Warning: count(): Parameter must be an array or an object that implements Countable in /w3/lt.vu.www4174/www/templates/gk_shop_and_buy/html/com_content/article/default.php on line 13

Duomenų bazės

Referentinių vaizdų duomenų bazė su nustatytu tiesos kriterijumi

Sukurtas referentinis (pamatinės tiesos) duomenų rinkinys, skirtas validuoti ir kalibruoti navikinio audinio aptikimo ir IHC teigiamų ląstelių identifikavimo algoritmus. Referentinių vaizdų kūrimui ir vaizdo analizės kokybės užtikrinimui naudoti Aperio sistemos įrankiai su Genie piešinio atpažinimo programa bei Aperio sistemos Stereologijos modulis. Duomenų rinkinį sudaro 17 226 svs formato vaizdai, skanuoti 20x didinimo režimu, 0,468 μm/vaizdo elementui (pixel‘iui) raiška. Duomenų rinkinyje pateikti 200 vaizdai, iliustruojantys atliktus imunohistocheminius testus pilno pjūvio mėginiuose ir 200 vaizdai, vaizduojantys atliktus imunohistocheminius testus mikrogardelių pjūviuose.
Referentinių vaizdų duomenų bazė pasiekiama tyrėjui suteikus prisijungimo vardą ir slaptažodį.

Vaizdų duomenų bazė vaizdo analizės įrankių kūrimui, validavimui ir tyrimams

Sukurta skaitmeninių vaizdų (SV) duomenų bazė vaizdo analizės įrankių kūrimui, validavimui ir tyrimams. Bazę sudaro archyvinių ir naujai pagamintų preparatų vaizdai, viso: 22 000 svs formato, 20x didinimo, 0.5µm rezoliucijos skaitmeniniai vaizdai. Vaizdų kolekciją sudaro diagnostinėje praktikoje taikomų (hormonų receptorių (ER, PR), HER2, Ki67) ir kitų, aktualių krūties vėžio imunohistocheminių (IHC) biožymenų (Ki67, EGFR, p53, CK5/6, CK18, MUC1, BCL2, HIF-1alfa, SATB1) pilno histologinio pjūvio ir audinių mikrogardelių skaitmeniniai vaizdai. Visi vaizdai turi identifikatorių – unikalų skanuoto vaizdo ID.
Visi vaizdai suderinti su Aperio SpectrumPlus skaitmeninio vaizdo analizės programomis. Vaizdus galima analizuoti įvairiais komerciniais programiniais įrankiais (Aperio Genie, Aperio Nuclear, Adcis Stereo ir kt.) su galimybe juos modifikuoti. Surinkti duomenų bazės vaizdai pritaikyti skaitmeninio vaizdo analizės algoritmų kūrimui atsižvelgiant tiek į analizuojamo biologinio žymens charakteristikas, tiek į skaitmeninio vaizdo parametrus.
Sukurta skaitmeninių vaizdų duomenų bazė pasiekiama per nuorodą: http://registracija.vpc.lt/vaizdai/. Prie duomenų bazės prisijungti gali tik registruotas tyrėjas, kuriam suteikiami prisijungimo duomenys: vartotojo vardas ir laikinas slaptažodis. Prisijungus pirmą kartą vartotojas slaptažodį pakeičia individualiu, ilgalaikiu.

Log In or Register

Siekdami užtikrinti jums teikiamų paslaugų kokybę, Universiteto tinklalapiuose naudojame slapukus. Tęsdami naršymą jūs sutinkate su Vilniaus universiteto slapukų politika. Daugiau informacijos